ハード：PS
値段：4,980円(別)
発売日：1999/6/24
開発：コナミ
ジャンル：アドベンチャー
裏技：
●どんどんステージが追加されていく
VR訓練モードで以下の条件をクリアする。すると、新しいモードが追加される。条件と出現するモードの関係は以下の通り。
・SNEAKING MODE-NO WEAPONの全PRACTICEと、WEAPON MODE-各武器 全PRACTICEをクリア…ADVANCED MODE。
・ADVANCED MODE各武器・全PRA CTICEをクリア…VS.12 BATTLE。
・SNEAKING MODE-NO WEAPONの全PRACTICEと、SNEAKING MODE-SOCOMの全PRACTICEと、WEAPON MODE-各武器全PRACTICEと、ADVAN CED MODE各武器 全PRACTI CEをクリア…VR-MISSION。
・クリア率50％…PUZZLE。
・クリア率60％…VARIETY。
・クリア率70％…MYSTERY。
・クリア率80％…NG SELECTION。
・ポケットステーション使用による（ウル技「忍者ステージ追加」参照）…NIN JA。
●開発者の言葉を
無線の周波数を140.07に合わせる。すると、各ステージで、ゲーム開発者からのメッセージが読める。
●幻のBGM
戦車戦時以外の雪渓谷、ウルフに勝ったあとの通信塔の通路、ウルフ戦時以外、通信塔の大雪原のどれかで無線の周波数を140.66に合わせる。すると、ボツになったBGMが流れる。
●衣装チェンジ
ゲームを2周クリアし、3周目を開始する。すると、スネーク、メリルともコスチュームが変化している。
●ムービー追加
VR訓練で、達成率を45%以上か75%以上にする。すると、映像特典の映像が増える。
●アニメーション鑑賞
ゲームをクリアする。そのデータをポケットステーションにセーブする。すると、アニメーションを見ることができる。内容はクリアしたときに得ていた称号によって違う。
●スリープ中
ポケットステーションにデータをセーブする。その状態で、ポケットステーションを1分以上放っておく。すると、ピーと音がして画面右上に「ビデオ」と表示れると、スリープ状態のスタンバイモードになる。決定ボタンを押せば、通常モードに戻る。
●忍者ステージ追加
ポケットステーションにクリアデータをセーブしておく。セーブしてから7日以内に、通信機能を利用して5人からクリアデータを集める。すると、VR訓練モードに「忍者ステージ」が追加される。同じクリアデータをコピーして使う、ポケットステーションの時刻を戻す、などの手は使えない。「BIG BOSS」の称号を得ると、それ1つだけで必要人数を満たしてしまう特例がつく。
●追加仕様が出現
本編のクリアデータをメモリーカードに保存する。すると、以下に示した追加仕様が出現する。・ストーリーに沿ってデモを鑑賞することができる「デモシアター」出現。・ニューゲームを始めると敵の配置が変わり、L2＋R2を同時に押しながらゲームを開始すると、オリジナルの配置でプレイできる。・主観移動可能モードが出現。・VR DISCの「EXTRA」内に「PHOTO GRAPH」モードが出現。