ハード：GC
値段：6,800円（別）
発売日：2003/2/28
開発：任天堂
ジャンル：アクション
裏技：
●サムスの顔が見られる
チョウゾルーインズのルーインズヤード通路で、足場の上にある反射板にチャージビームを撃つと、バイザーに、サムスの顔と目が映りこむ。
●ファミコン版「メトロイド」がプレイできる
GBA版の『メトロイドフュージョン』をクリアしたセーブデータとGC本体を接続ケーブルでつなぎ、メニュー画面にしたがって操作すると、ファミコン版を忠実に移植した『メトロイド』をプレイすることができる。
●サムスのスーツが変化する
ゲーム本編のクリアデータがある状態で、GBA版『メトロイドフュージョン』を接続ケーブルでつなぐと、GBA版のフュージョンスーツで、GC版をプレイできるようになる。
●100％クリア時の特典
ログブックを100％にした状態でゲームをクリアすると、以下の要素がおまけとして追加される。
・ギャラリーが6ページまでオープンになる。・エンディングでサムスの素顔が見られる。・エピローグに映像が追加される。
●ハードモードでプレイ
一度ゲームをクリアしたセーブデータがある状態で「New Game」を選び、最初からゲームを始めると、敵の攻撃力などがアップした「ハードモード」をプレイできるようになる。
●ギャラリーモードのオープン条件
ゲーム中に以下の要素を満たすと、4つあるギャラリーモードがオープンになる。・ギャラリー1…スキャン率が50％以上になる。
・ギャラリー2…スキャン率が100％になる。
・ギャラリー3…「ハードモード」をクリアする。
・ギャラリー4…アイテム収集率を100％にする。