ハード：GBA
値段：4,800円（別）
発売日：2003/12/12
開発：カプコン
ジャンル：アクションRPG
裏技：
●バリアブルソードのバトルチップの隠しコマンド
戦闘時にバリアブルソードのバトルチップを選び、Aを押しながら十字ボタンで素早くコマンドを入力すると、攻撃範囲や性能が通常とは異なる技が出せる。
・ロングソード…Aを押しながら下、右下、右。
・ファイターソード…Aを押しながら左、左下、下、右下、右。
・ワイドソード…Aを押しながら上、右、下。
・ドリームソード…Aを押しながら下、左、上、右、下。
・ソニックブーム…Aを押しながら左、B、右、B。
●ネオバリアブルのバトルチップの隠しコマンド
戦闘時にネオバリアブルのバトルチップを選び、Aを押しながら十字ボタンで素早くコマンドを入力すると、攻撃範囲や性能が通常とは異なる技が出せる。
・クロスソード…Aを押しながら下、右、上。
・スーパーソニック…Aを押しながら左、右、左、B。
・ダブルドリーム…Aを押しながら上、B、下、B、上、B。
●その他のバトルチップの隠しコマンド
以下の特定のチップを装備して、戦闘時にコマンドを入力すると、通常とは違った技が出せる。
・ファイアマンDS…技が出るまでに下、右と入力。
・メタルマンDS…技が出るまでに、Aを押しながら十字ボタンのどれかを押す。
・サーチマンDS…カーソルを止める時にA＋B。
・ウッドマンDS…着地の瞬間にA＋B＋下。
・レーザーマンDS…レーザー発射時に十字ボタンのいずれかを押す。
・シェードマンDS…技が出るまでに下、右下、右＋A。または下、左下、左＋A。
●予備フォルダが増える
ゲーム中に特定の場所にいるキャラと会って話をすると、全部で4つの予備フォルダを入手できる。
・オマケフォルダ…シェロ
・カスティロのエントランスにいる人形と話す。・ミナライフォルダ…2周目のプレイで、電気街1丁目にいる男と話す。
・メイジンフォルダ…3周目のプレイで、デンサンドームのスタジアムにいる男と話す。
・ヘッポコフォルダ…第1部の「ボンボンテルオの作戦」シナリオで、秋原町にいるおばあさんと話す。なおヘッポコフォルダは1周目から3周目まで入手が可能。周によって入っているチップが違う。
●フォルテのチップを入手
ゲームを3周目まで進める。ソウルを6つ集めた状態でウラインターネット4へ進み、スタンダードチップを150枚集めてウラインターネット5へ進み、最深部にいるフォルテと対戦して勝つと、フォルテチップ（『レッドサン』）とフォルテアナザーチップ（『ブルームーン』）をそれぞれ入手できる。
●隠しロットナンバーでレアアイテムをゲット
ゲーム中に特定のポイントへ移動する。隠しロットナンバーを入手できるので、このナンバーをナンバートレーダーに打ち込むと、レアアイテムが手に入る。ロットナンバーの隠し場所ともらえる景品は以下の通り。
・シェロ・カステロ入り口の看板…ミニエネルギー。
・きゅうけつきのやかたのしかけ人形…アントラップ。
・デンサンドーム控え室のゴミ袋…フレイムライン1G。
・コロッセオアベニュー遺跡の柱（2周目以降のプレイで出現）…ワイドショット3T。
・アジーナのガスボンベ（2周目以降のプレイで出現）…フレイムライン3J。
・ANSA観測室2階のコンピュータ（2周目以降のプレイで出現）…エアホッケー3V。
・シャーロ民家の扉（2周目以降のプレイで出現）…ツインファング3J。
・ウラインターネット3の、坂道の裏に隠れている悪ナビ…リカバリー300J。
・きゅうけつきのやかたにいる、オズマ監督と話す…ガンデルソルEXG。
●『ロックマン ゼロ3』との通信でZセイバーを入手
『ロックマンゼロ3』と『エグゼ4』を通信ケーブルで接続し、バトルチップのトレードを行う。『ゼロ3』側からZセイバーのチップを送ってもらう（こちらが送るチップは適当でよい）。すると、Zセイバーを入手できる。
●ブラックアースでロックマンDSと対決
①ゲームの3周目以降のウラインターネットに出現するエレンプラEXを倒して、エレメントダークのチップを入手。②フォルテを倒した状態でウラインターネット5のウイルス10連戦に勝ち、ムラマサブレード、ポイズンアヌビス、ブラックウイングのチップを入手。③シェードマンSPとレーザーマンSPを倒し、バグチャージ（レッドサンで出現）か、カースオブバグ（ブルームーンで出現）のチップを入手。④上記の5枚の暗黒チップを集めた状態でウラインターネット6へ行くと、隠しエリア
・ブラックアースでロックマンDSと対決できる。
●ラスボスがデューオSPになる
タイトル画面に7つのマーク（1周目クリア、全ソウル入手、スタンダードチップ入手、全メガクラスチップ入手、全ギガクラスチップ入手、全P.Aメモ入手、フォルテSP）が揃っている状態で、新規にゲームを始めると、ラスボスがデューオSPになる。
●隠しロットナンバーでレアデータを入手
ヒグレヤにあるナンバートレーダーに、特定のナンバーを入力すると、レアデータが手に入る。データごとのナンバーは以下の通り。・ラッシュサポート…73298100。
・ビートサポート…25435428。
・タンゴサポート…10170506。
・カモンスネークR…32108251。
・フルエネルギー…59891137。
・ボディパック…43494372。
・バスターパック…5178924。
・HP＋500…30873624。
・カスタム2…75420107。
・メガフォルダ2…2109544。
●ハードモードが出現
ノーマルモードでゲームをクリアすると、ハードモードが遊べるようになる。
●アルティメットモードが出現
パーツを全て取り、サイバーナビをレベル7にしてゲームをクリアすると、アルティメットモードが遊べるようになる。
●ミニゲームが遊べる
条件を満たしてゲームをクリアすると、ミニゲームが出現する。出現するミニゲームと条件の対応は以下の通り。
・ウッドチョッピング…最終ステージを評価Sでクリア。
・エルフチェイス…チップを一切開発せずにクリア。